不同A型流感病毒亞型影響的動物不盡相同,目前發現可能影響的動物包含禽鳥類、豬、蝙蝠、犬隻、貓及馬等,其中以禽鳥類與豬為最常見,當A型流感病毒感染禽鳥類造成之疾病稱為「禽流感」,若感染於豬隻造成疾病則稱為「豬流感」。動物流感病毒一般不會感染人類,僅偶發性出現人類感染動物流感的情形,當感染動物的A型流感病毒感染到人,使人類生病時,我們就將此病症歸為「新型A型流感」。